Ernst Wally ukończył Diözesankonservatorium für Kirchenmusik der Erzdiözese w Wiedniu (organy Franz Falter) oraz wiedeński Universität für Musik und darstellende Kunst w klasie organów ( Michel Radulescu) i kompozycji (Dieter Schermann, Michael Jarrell). Brał także udział w kursach mistrzowskich w zakresie kompozycji organizowanych przez Conservatoire Nationale de Musique et de Danse de Paris (pod kierunkiem Frederique Durieux).
Od 2007 roku Artysta związany jest z katedrą św. Szczepana w Wiedniu, początkowo jako asystent muzyczny, zaś w 2016 roku został pierwszym organistą świątyni.
E. Wally regularnie współpracuje z Orkiestrą Radia Wiedeńskiego, Wiedeńską Filharmonią, a także z Tonkünstler Orchestra oraz Gesellschaft der Musikfreunde in Wien.
Jego utwory były wykonane m.in. podczas prestiżowego festiwalu Carinthischer Sommer. W 2015 roku Wally jako organista i kompozytor brał udział w międzynarodowej inicjatywie Orgelbüchlein Project, której celem było uzupełnienie bachowskiego zbioru preludiów chorałowych pod tym samym tytułem.