Absolwent krakowskiej Akademii Muzycznej w klasie organów (Józef Serafin, Arkadiusz Bialic) oraz klawesynu (Magdalena Myczka, Andrzej Zawisza). Odbył studia podyplomowe w Hochschule für Musik we Freiburgu (Martin Schmeding), a także jako stypendysta przez rok kształcił się w Hochschule für Musik und darstellende Kunst w Stuttgarcie (organy Ludger Lohmann, klawesyn Jörg Halubek).
Obecnie w krakowskiej uczelni odbywa studia doktoranckie, a także studia podyplomowe w Akademii Muzycznej w Katowicach.
Do najważniejszych osiągnięć artystycznych M. Kocota należą:
I miejsce na Ogólnopolskim Konkursie Muzyki Organowej J. Alaina w Krakowie;
I miejsce na XVIII Międzynarodowym Konkursie Organowym im. L. Janacka w Brnie oraz nagrodę specjalną na najlepszą interpretację utworu M. Stedronia;
II miejsce na VIII Międzynawowym Konkursie Organowym im. M. Tariverdieva w Kaliningradzie oraz nagrodę specjalną za najlepsze wykonanie utworu M. Tariverdieva;
II miejsce na XII Międzynarodowym Konkursie Organowym im. Gottfrieda Silbermanna we Freibergu;
I miejsce (nagroda bachowska – Bachpreis) na XX Międzynarodowym Konkursie Organowym w Wiesbaden.